這個智能集菌儀的作用是檢驗供試品是否含菌的儀器，配套集菌培養器使用。它的一個檢測過程是這樣的：讓供試品通過進樣管道連續被注入智能集菌儀培養器中，然后利用集菌培養器內形成的下壓，通過0.45微米孔徑的濾膜過濾，供試品中可能存在的微生物被截留收集在濾膜上，我們通過沖洗濾膜除去供試品的成分。然后就可以把所需培養基通過進樣管道直接注入集菌培養器中，放置規定的溫度培養，觀察是否有長菌現象。它可以用于食品、飲料行業等微生物限度檢查。
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